完美的稽查執(zhí)法流程，是新《海關稽查條例》《〈海關稽查條例〉實行方法》的重要亮點。新《海關稽查條例》《〈海關稽查條例〉實行方法》通過科學的流程設計，可有效防止執(zhí)法人員不作為、亂作為。主要流程包含：

一是完美查告訴制度。新《海關稽查條例》《〈海關稽査條例〉實行方法》規(guī)定的告訴內(nèi)容包含告訴稽查的實行、告訴被稽查人的權力、告訴稽查結論，同時還特殊規(guī)定發(fā)覺被稽查人涉嫌違法或者少征、漏征稅款的，應該書面征求被稽查人看法，充分保障了被稽查人的知情權、論述權、申辯權以及追求法律救援等權力。

二是明白躲避制度。新《海關稽查條例》規(guī)定，海關進行稽查時，海關工作人員與被稽查人有直接利害關系，應該躲避；新《〈海關稽查條例）實行方法》對躲避制度進行細化規(guī)定，確保躲避制度落到實處。

三是強化監(jiān)視制約機制。新《海關稽查條例》明晰了內(nèi)部層級核批制度，將海關行使重大稽查職權的內(nèi)部核批由“經(jīng)海關關長同意”明白規(guī)定為“經(jīng)直屬海關關長或者其授權的附屬海關關長同意”，同時還提高完美了海關稽查執(zhí)法資歷制度和雙人作業(yè)制度等，規(guī)范執(zhí)法行為，強化監(jiān)視制約。